期刊论文

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安徽农业大学学报

1672-352X

2022

49

1

69-75

10.13610/j.cnki.1672-352x.20220325.005

国家自然科学基金（31201718,31402025）； ***和创新团队发展计划项目（IRT13054）； 湖南省生物发育工程及新产品研发协同中心项目（20134486）； 衡阳师范学院科学基金科研项目（18D16）； “南岳山区生物资源保护与利用”湖南省重点实验室开放基金项目（NY20K05）； 湖南省教育厅科学研究项目（20C0273）共同资助；

本校为第一机构

首次对中国瘰螈皮肤组织进行了转录组测序并分析其活性多肽。提取中国瘰螈皮肤组织总RNA用于构建c DNA文库，采用Illumina HiSeq 4000进行测序。测序数据处理后获得unigene，并对其进行基因注释和生物信息学分析。共组装获得了74 371个非冗余unigene（平均长度为762 bp），其中33 627个unigene在七大功能数据库中得到功能注释，5 137个unigene的注释结果来自两栖类物种，约占注释总数的15%。另外，从转录组数据中识别了一些皮肤活性多肽如胆囊收缩素、防御素、伤口愈合肽、蛋白激酶抑制剂、胸腺素，它们大多数具有皮肤免疫或防御功能，且在其他两栖动物种类中均发现有较高序列相似性的同源多肽。...

In this study,for the first time,transcriptome sequencing of Paramesotriton chinensis skin tissue was performed and its active peptides were analyzed.The total RNA was extracted from skin tissue of P.chinensis and used to construct a cDNA library.The cDNA library was sequenced by Illumina HiSeq 4000.The unigenes were obtained after sequence data processing,and its gene annotation and bioinformatics analysis were carried out.In current work,a total of 74371 non-redundant unigenes(with an average length of 762 bp)were assembled,among which 33627 unigenes were annotated in seven functional databa...