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蓝尾蝾螈皮肤转录组及活性多肽分析

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成果类型:
期刊论文
作者:
唐兴;王洪亮;梁广男;刘雅莉;段志贵
作者机构:
[唐兴] 衡阳师范学院生命科学与环境学院,湖南 衡阳421008
[唐兴] 衡阳师范学院南岳山区生物资源保护与利用湖南省重点实验室,湖南 衡阳421008
[唐兴] 东华理工大学江西省质谱科学与仪器重点实验室,江西南昌330013
湖南师范大学动物多肽药物国家地方联合工程实验室,湖南长沙410081
[刘雅莉; 梁广男] 东华理工大学
语种:
中文
关键词:
蓝尾蝾螈;转录组测序;活性多肽;基因注释;生理学功能
关键词(英文):
Cynops cyanurus;transcriptome sequencing;active peptide;gene annotation;physiological function
期刊:
福建农林大学学报(自然科学版)
ISSN:
1671-5470
年:
2022
卷:
51
期:
1
页码:
90-97
基金类别:
31201718:国家自然科学基金 31402025:国家自然科学基金 :*** IRT13054:创新团队发展计划 :湖南省生物发育工程 20134486:新产品研发协同中心项目 18D16:衡阳师范学院科学基金科研项目 NY20K05:南岳山区生物资源保护与利用湖南省重点实验室开放基金项目 20C0273:湖南省教育厅科学研究项目
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
生命科学与环境学院
摘要:
通过对蓝尾蝾螈皮肤进行转录组测序,首次报道了蓝尾蝾螈皮肤的转录组及其活性多肽成分.采用Illumina Hiseq4000共测定了6.65 Gb数据;组装和去冗余后共获得75 462个unigene,其N50、GC含量、平均长度、总长度分别为1 617 bp、45.64%、818 bp、61 801 999 bp.通过基因注释,共获得34 850个非冗余注释unigene(占unigene总数的46.18%),注释结果为两栖类物种的unigene数目约占注释总数的16%.根据unigene的COG和GO注释结果,统计了各自的功能分类.其中,对鉴定到的多种活性多肽进行了初步的生物信息学分析,为诠释蓝尾蝾螈皮肤生理学功能提供依据.

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