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拟穴青蟹(Scylla Paramamosain)微卫星位点开发——基于(AG)_(12)探针杂交

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成果类型:
期刊论文
作者:
宋忠魁;聂振平;谢达;王芳宇
作者机构:
广西海洋研究所广西海洋生物技术重点实验室 北海 536000
钦州学院化学与生物系钦州 535000
衡阳师范学院生命科学系 衡阳421008
语种:
中文
关键词:
FIASCO技术;磁珠富集法;拟穴青蟹;微卫星
期刊:
海洋与湖沼
ISSN:
0029-814X
年:
2013
卷:
44
期:
1
页码:
171-176
基金类别:
广西科学基金项目,0991275号 广西科学研究与技术开发计划项目,11107012-11号 广西海洋生物技术重点实验室主任基金课题,0801号.
机构署名:
本校为第一机构
院系归属:
生命科学与环境学院
摘要:
采用FIASCO (Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats)技术和磁珠富集方法开发拟穴青蟹微卫星位点。结果表明,400bp以下长度的序列含微卫星的概率超过400bp以上长度的序列;从二碱基重复类型到五碱基重复类型,完美型微卫星的概率在增加。利用设计的28对引物扩增一个供试群体,其中12对引物能稳定扩增且片段大小基本符合理论长度,10个微卫星位点表现出高度多态性,9个微卫星位点显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P〈0.05),两组两两位点间存在连锁不平衡现象((P〈0.0042,经Bonferroni法校正)o Micro-Checker分析揭示其中的5个微卫星位点可能存在无效等位基因。排除混合微卫星...
摘要(英文):
FIASCO (Fast Isolation by AFLP Sequences Containing repeats) technique and magnetic bead enrichment method were used to develop microsatellite loci of the mud crab Scylla paramamosain. The results showed that more microsatellite sequences distributed within the range of 400bp in length and the probabilities of perfect microsatellite increased from di-to pentamer repeated types. 28 primer pairs were designed to amplify a sampling population, while 12 polymorphic loci were amplified, whose length conformed to theory size basically. Ten loci dis...

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